佳木斯大学办公室是学校党政综合管理办事机构，下设文秘科、综合业务科、法制科、督办科、机关党委办公室、驻哈办、校友会办公室、档案馆8个科室。主要工作职责是负责组织安排党委常委会议、校长办公会议和其他重要会议；负责协调校领导工作安排和联络；负责协调校内突发事件和重要事件；负责学校有关文件的起草，收文、发文的批办及印信管理工作；负责信息公开工作；负责协调落实全面从严治党工作、法治建设工作、市校共建工作、对外联络和接待工作，受理信访工作；负责保密工作；负责学校校友工作，教育发展基金会的运营管理工作；负责完成学校和上级有关部门交办的其他工作。